- Văn phòng có Chánh Văn phòng và các Phó Chánh Văn phòng, số lượng Phó Chánh Văn phòng do Chủ tịch UBND TP quyết định. Chánh Văn phòng, Phó Chánh Văn phòng do Chủ tịch UBND TP bổ nhiệm, miễn nhiệm, khen thưởng, kỷ luật theo quy định của pháp luật.
- Văn phòng làm việc theo chế độ thủ trưởng, Chánh Văn phòng là người chỉ đạo, điều hành toàn bộ các hoạt động của Văn phòng; sắp xếp tổ chức, bộ máy Văn phòng theo quy định; chịu trách nhiệm trước UBND TP và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Văn phòng; là chủ tài khoản cơ quan Văn phòng.
- Chánh Văn phòng ký các văn bản thuộc phạm vi điều hành, phối hợp, đôn đốc các Sở, UBND quận - huyện chuẩn bị các đề án trình UBND TP; thư mời họp của Chủ tịch, Phó Chủ tịch UBND TP; thông báo truyền đạt ý kiến chỉ đạo của Chủ tịch, Phó Chủ tịch UBND TP để các Sở, UBND quận - huyện thực hiện; cung cấp thông tin cho các cơ quan thông tin đại chúng về hoạt động của UBND, Chủ tịch, Phó Chủ tịch UBND TP về tình hình kinh tế - xã hội, an ninh, quốc phòng theo quy định của pháp luật; sao y các văn bản và thừa lệnh Chủ tịch UBND TP ký các văn bản để thực hiện công việc khác do Chủ tịch UBND TP ủy quyền.
- Phó Chánh Văn phòng là người giúp việc cho Chánh Văn phòng, được Chánh Văn phòng phân công theo dõi từng khối công việc và chịu trách nhiệm trước Chánh Văn phòng, trước pháp luật về các lĩnh vực công việc được phân công phụ trách.
- Văn phòng gồm: khối Nghiên cứu, tổng hợp; khối Hành chính; khối sự nghiệp.
- Khối Nghiên cứu, tổng hợp gồm các Phòng: Tổng hợp - Kế hoạch; Tài chính - Thương mại - Dịch vụ; Công - Nông nghiệp; Đầu tư; Đô thị - Môi trường; Đối ngoại; Pháp chế - Nội chính; Văn xã; Kiểm soát Thủ tục hành chính.
- Khối Hành chính gồm các Phòng: Hành chính – Tổ chức; Kế toán – Tài vụ; Quản trị.
- Khối sự nghiệp gồm các đơn vị: Trung tâm Công báo; Trung tâm Tin học; Nhà khách Hương Sen.
- Mỗi Phòng, đơn vị đều có Trưởng phòng, Giám đốc và các Phó Trưởng phòng, Phó Giám đốc do Chánh Văn phòng UBND TP bổ nhiệm, miễn nhiệm theo phân cấp quản lý cán bộ.
- Các Phòng, đơn vị xây dựng quy chế làm việc và phân công cụ thể nhiệm vụ của các chuyên viên trong Phòng, mối quan hệ, cơ chế phối hợp giữa các Phòng, các khối, trình lãnh đạo Văn phòng xem xét phê duyệt.
- Việc thành lập, sáp nhập, giải thể các Phòng, đơn vị do Chủ tịch UBND TP quyết định.
- Tùy theo tình hình nhiệm vụ và yêu cầu công tác của Chủ tịch và các Phó Chủ tịch UBND TP, các Phòng, các Trung tâm sẽ được sắp xếp, bố trí lại hoặc thành lập mới cho phù hợp trên cơ sở đề xuất, kiến nghị của Chánh Văn phòng và Sở Nội vụ.
(Theo Quyết định số 63/2011/QĐ-UBND ngày 11/10/2011 của UBND TP về ban hành Quy chế tổ chức và hoạt động của Văn phòng UBND TPHCM)